在桐凝离开之后不久，小茂也是带着他的一众拥趸离开了。至于等待小智一起旅行只不过是借口而已。
在二人都离开之后不久，最后的妙蛙种子也是被人领走了。
将三个空的精灵球重新摆放好，一直等到大木博士的都昏昏欲睡的时候，终于一个穿着睡衣毛毛躁躁的身影出现在了研究所门口。
“好了，喘口气，不要着急。”大木博士老神在在的和小智打了一个招呼。
“不好意思，博士。我迟到了，请给我神奇宝贝吧。”
面对着小智的请求，大木博士转身打开三颗空空如野的神奇宝贝球。“如你所见，已经全部都没有了。”
“什么，难道我要一个人开始旅行。”
“貌似是这样的，或者你可以再等一年和明年的训练家们一起出发旅行。”
“什么！博士，那么将精灵球给我吧。”
没错，超级真新人小智，没有撤退可言，就算是肉搏，他也要出发踏旅途。
“别急，我这里确实还有一只神奇宝贝，只是不知你要不要了？”
“要！”
听到小智的回答，大木博士又一次来到精灵球的放置台，再按下一个按钮之后，一枚有着雷电标记的宝贝球缓缓升起。
“嘛，不过这只神奇宝贝是有一点问题的。”大木博士想到这只皮卡丘的性格，友情提示道。
“没关系，我就要这只。”小智眼看还有希望，也不管有没有问题了，反正再大的问题也比自己撸袖子肉搏野生神奇宝贝靠谱。
刺啦～
打开宝贝球的一瞬间，一道耀眼的雷蛇冒出，雷光闪闪，强烈的电流让小智整个人都变成了焦黑色，倒地不起。
看着躺在地的小智，以及皮卡丘，大木博士笑着解释道：“这只神奇宝贝叫做皮卡丘，它又叫电气鼠，性格内向害羞不亲人，未经允许就碰她，就会这个样子。”
听到大木博士的解释，小智站起来不信邪的又一次凑到了皮卡丘的身边。
皮卡~丘！！！
一道电光闪过，小智又一次躺在了地。
看着一人一宠的互动，大木博士露出了满意的微笑。
在野外见到这只皮卡丘的第一眼，大木博士就认出了它。
某年某月，年轻的大木雪成在成都地区，邂逅了一位正义的训练家，以及他的搭档皮卡丘，两人携手拯救了穿越时空的神兽雪拉比，也结下了深厚的友谊。
哪怕已经过去了这么长的时间，但是年少时的美好回忆依旧历历在目。
虽然在回忆童年，但是大木博士也没有忘记正事，拿出图鉴和宝贝球，“诺。这是神奇宝贝球和图鉴，抓紧时间吧。”
“好的，那你就等我的好消息吧。”借过新手装备，小智就领着皮卡丘美滋滋的出发了。
出了门，小智的妈妈和街坊们将大木博士研究所门口堵住了，大家一起祝福小智踏旅途。
在经历一番鸡飞狗跳后，皮卡丘和小智总算告别了真新镇的大家，踏了属于他们的旅途。
在进入常磐森林之后，小智便遇到一只野生的波波，而后小智便捡起石头准备出击，不过小智一石头拍去之后出来的却是成群结队的烈雀。
眼睑情况不对，小智也是抱起皮卡丘撒腿就跑。
在烈雀的助攻之下，小智终于是和皮卡丘解开了心结，为以后二人的羁绊建立了坚实的基础。
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