不过，罢免的真正理由，如果要说到他反对立刘德妃，真宗又是难以启齿的，担心授人以柄。于是找了一些赵安仁在处理政务上的瑕疵来说事儿。
对此，王旦不仅轻而易举地驳回了真宗所列举的所谓理由，还暗中指责了“迎合陛下意”的王钦若。大意是说赵安仁在处理政务上又得体又称职，朝廷中打着灯笼都难找这般称职的大臣。
真宗讨个没趣，只好收回要求，讪讪地说：“我也不知道情况是这样，既然赵安仁如此称职，那么就让他继续好好干吧。”
这下王钦若等于放了空响炮。
但他哪里会善罢甘休，既然王旦是赵安仁的保护伞，接下来更把矛头直接对准了王旦。
只因为王旦是寇准的继任者，当年不仅曾经和寇准互相声援，且和赵安仁是挚交，王钦若自然有充足的理由把王旦视为仇雠。
王旦曾打算提拔翰林学士李宗谔出任参知政事。依照办事程序，他把这项人事议案告诉了知枢密院事的王钦若，并说准备呈报给皇帝。
王钦若灵机一动，当时什么也没说。
李宗谔家境贫困，坊间传言说，李宗谔曾为了婚嫁事向王旦借了不少债。而一旦被任命参知政事，则可得到将近三千缗的赏赐，用来还债绰绰有余。
又一次陪真宗下棋，王钦若绘声绘色地说：“李宗谔欠了王旦私钱无力偿还，王旦无奈，打算推荐李宗谔做参知政事，把所得赐物以偿己债，臣窃以为这是私心杂念作祟，非为国择贤之举也。”
对这个小报告，真宗一开始非常反感。他自知了解王旦的人品，相信王旦绝不会做出这等勾当。在他的脑海里，有一幕难忘的景象迄今栩栩如生，那还是咸平四年（1001）冬十月的事，契丹入侵宋边境，边境告急，在寇准的支持下真宗亲征，王旦随真宗至澶渊。
这时传来留守东京(今开封)的雍王元份突然染上暴疾的消息，真宗立刻命王旦乘驿马速回掌理留守事宜。
临行之前，王旦对真宗说：“愿陛下召寇准来见，臣有话要当面跟他说。”
寇准来到后，王旦当着寇准的面奏问真宗：“十月之内，如果收不到捷报，臣应当如何处理呢?”
真宗看看寇准，沉默了好一阵子才说：“这个嘛，那就立皇太子吧!”
原来是让真宗表态，让寇准作证。拿到真宗的表态，王旦于是连夜赶回东京。到京后，便直接入宫理事，并严令保守秘密，不得对外传播他人已在京城之事。
及真宗还驾日，王旦子弟、亲戚及家人都在城外，准备迎接王旦同时归来，这时忽然听到后面传来开道的声音，大家急忙转身往后看，原来正是王旦——敢情他一直在京城里留守啊。
真宗对这个场景记忆犹新。通过这件事，真宗知道王旦为官公私分明，深知在大敌当前之际保守秘密的重要性和必要性，即使对自己的亲戚也不例外。自此真宗对王旦信任有加。
而且王旦知人善任，所以真宗对王钦若的密奏半信半疑。
但第二天朝会的时候，王旦果真提名李宗谔为参知政事。
真宗的脸色马上变了，想都没想，当场予以否决。
这是王旦在长达将近十八年的朝廷执政与宰相任内，所提出的人事任免议案唯一未获真宗批准的案例。
王旦似乎并没有辩解之意，也没有追问真宗否决的原因，当然真宗也就没有向王旦说明。
这事令王旦十分尴尬。他是一个非常敏感的人，知道真宗对自己的信任已经到头了，而这其中原因不言而喻。
他不得不同意王钦若提案：改任丁谓为参知政事。
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